La devoción a la Oración en el Huerto surge en Granada a mediados del siglo XVI.

Permanece en San Antón hasta los primeros años del siglo XX, participando en el Desfile Antológico.

La cofradía se funda en Abril de 1943 en la sacristía de la Parroquia de Santa Escolástica (Iglesia de Santo Domingo).

Las reglas son aprobadas por el Cardenal Parrado en Abril de 1943.

La cofradía realiza su primera salida el día 2 de Abril de 1944.

En 1957 se borda el manto de María Santísima de la Amargura Coronada por las MM Trinitarias.

Los varales son obra de Moreno.

Desde 1960, tiene la sede canónica en el Real Monasterio de la Madre de Dios de Comendadoras de Santiago.

Los respiraderos, jarras y brazos de cola son obra de Manuel de los Ríos.

Entre los años 2004 al 2012 se realiza la candelería que es obra de Donoso.

Se realiza la corona canónica de María Santísima de la Amargura Coronada, obra de Alberto Quirós, siguiendo modelos dieciochescos, en plata de ley, piedras preciosas y oro, regalo de sus devotos, contiene una reliquia del velo de la Virgen, saya de la coronación bordada en oro y sedas sobre tisú dorado con diseño de Fray Ricardo de Córdoba,